Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Surf4Q64310 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Surf4Q64310 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms