Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim24Q64127 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim24Q64127 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms