Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp248Q640N4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp248Q640N4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp248Q640N4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp248Q640N4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp248Q640N4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp248Q640N4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp248Q640N4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp248Q640N4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Zfp248Q640N4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Zfp248Q640N4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Zfp248Q640N4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zfp248Q640N4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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