Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Aebp1Q640N1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms