Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ndufa4Q62425 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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