Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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AtmQ62388 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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AtmQ62388 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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AtmQ62388 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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AtmQ62388 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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AtmQ62388 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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AtmQ62388 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtmQ62388 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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AtmQ62388 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtmQ62388 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms