Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sin3bQ62141 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms