Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Foxd1Q61345 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Foxd1Q61345 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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