Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cln3Q61124 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Cln3Q61124 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Cln3Q61124 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Cln3Q61124 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Cln3Q61124 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cln3Q61124 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cln3Q61124 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cln3Q61124 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms