Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Klf3Q60980 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms