Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Slc6a4Q60857 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Slc6a4Q60857 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc6a4Q60857 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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