Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp3Q60770 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp3Q60770 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms