Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mkrn3Q60764 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mkrn3Q60764 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms