Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd4Q60688 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd4Q60688 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms