Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sin3aQ60520 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms