Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Utp20Q5XG71 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Utp20Q5XG71 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms