Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bbs12Q5SUD9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms