Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf215Q5SPX3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms