Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc85aQ5SP85 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85aQ5SP85 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms