Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ecm2Q5FW85 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms