Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
L1td1Q587J6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
L1td1Q587J6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms