Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
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Znf608Q56A10 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Znf608Q56A10 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Znf608Q56A10 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Znf608Q56A10 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Znf608Q56A10 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Znf608Q56A10 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Znf608Q56A10 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms