Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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