Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rhox3aQ4TU90 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms