Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm10488Q4KL05 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm10488Q4KL05 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms