Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syne3Q4FZC9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syne3Q4FZC9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms