Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx25Q3ZT31 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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