Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn13Q3UW68 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn13Q3UW68 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms