Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm28047Q3US59 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms