Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
E130208F15RikQ3UPV3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms