Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sec31aQ3UPL0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms