Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms