Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp30Q3UN04 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms