Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc33Q3ULW6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc33Q3ULW6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms