Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ceacam5Q3UKK2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ceacam5Q3UKK2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms