Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc34Q3UI66 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms