Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nkx6-3Q3UHX8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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