Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mier3Q3UHF3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms