Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atxn7l3bQ3UD01 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atxn7l3bQ3UD01 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms