Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pid1Q3UBG2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pid1Q3UBG2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms