Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LbrQ3U9G9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms