Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rnf180Q3U827 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf180Q3U827 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Rnf180Q3U827 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf180Q3U827 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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