Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Fam117bQ3U3E2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Fam117bQ3U3E2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Fam117bQ3U3E2 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Fam117bQ3U3E2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam117bQ3U3E2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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