Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Otud5Q3U2S4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Otud5Q3U2S4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms