Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf149Q3U2C5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms