Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Palb2Q3U0P1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Palb2Q3U0P1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms