Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rufy4Q3TYX8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms