Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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