Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21440Q3TTD8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms