Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdpd4Q3TT99 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdpd4Q3TT99 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms